Powodująca zapalenia przyzębia bakteria Porphyromonas gingivalis naturalnie występuje w jamie ustnej. Gdy obszar ten cechuje się zdrowiem, bakteria ta, jak i inne drobnoustroje chorobotwórcze, kontrolowana jest przez pożyteczne dla tkanek jamy ustnej mikroorganizmy. Kiedy jednak równowaga mikrobiologiczna zostaje zakłócona, P. gingivalis staje się główną przyczyną chorób przyzębia i ciężkiej zapalnej choroby dziąseł. Jeśli schorzenia te nie są leczone, doprowadzają do zniszczenia dziąsła i kości utrzymującej zęby na miejscu.

P. gingivalis może także przedostać się do warstw błony śluzowej jamy ustnej i tam przetrwać, a następnie wyniknąć do głębiej położonych tkanek i rozprzestrzenić się ogólnoustrojowo. Powoduje to, że coraz częściej bakterię tę wiąże się z takimi schorzeniami, jak choroba Alzheimera, cukrzyca i nowotwory przewodu pokarmowego. Ostatnio zaobserwowano również, że u pacjentów z rakiem jamy ustnej i zakażonych tą bakterią wyniki leczenia z wykorzystaniem chemioterapeutyków są gorsze. Oznacza to, że P. gingivalis może niekorzystnie wpływać nawet na leczenie onkologiczne ratujące życie.