Struktury jamy ustnej są bardzo dobrymi źródłami komórek macierzystych. Komórki te można pozyskać z zębów – mlecznych lub stałych, także z zębów mądrości. Można je również pobrać z więzadeł ozębnowych, brodawki wierzchołkowej, która daje początek miazdze w korzeniu zęba, z wyrostka zębodołowego, zarodków zębów, a nawet z dziąseł.

Komórki macierzyste pobrane z tych struktur wykorzystywane są obecnie nie tylko do regeneracji tkanek zębów, ale także do leczenia uszkodzeń wywołanych przez choroby przyzębia. Coraz częściej także korzysta z nich medycyna – w wielu swoich specjalizacjach. Komórki macierzyste z jamy ustnej znajdują zastosowanie w leczeniu schorzeń ogólnych, systemowych czy narządowych na przykład w schorzeniach neurologicznych, wątroby, narządu wzroku, kości. Stosuje się nawet do leczenia cukrzycy, ponieważ pomagają zregenerować uszkodzone komórki trzustki odpowiedzialne za wytwarzanie insuliny. Komórki macierzyste są wykorzystywane także do aktywowania procesów tworzenia nowych naczyń krwionośnych i rozbudowy sieci tych naczyń, co jest przedmiotem zainteresowania głównie kardiologów z uwagi na możliwość zastosowania w leczeniu choroby niedokrwiennej serca.