Elektroniczne papierosy są uważane za mniej szkodliwą alternatywę dla tradycyjnych wyrobów tytoniowych. Istnieją też pewne dowody na potencjalną pozytywną rolę e-papierosów jako środka wspomagającego rzucenie palenia tradycyjnego. W środowisku medycznym istnieją jednak obawy co do konsekwencji zdrowotnych wynikających z używania elektronicznych odpowiedników zwykłych papierosów – szczególnie podczas ich długotrwałego stosowania oraz w przypadku użytkowników, którzy dotychczas nie palili tytoniu. Istnieje bowiem możliwość wystąpienia poważnych konsekwencji zdrowotnych, także dla jamy ustnej. W badaniach wykazano szereg negatywnych efektów komórkowych wynikających ze stosowania e-papierosów. Odnotowano również, że palenie e-papierosów zmienia mikrobiom jamy ustnej na niekorzyść dla zdrowia, gdyż pojawiają się bardziej patogenne szczepy drobnoustrojów. Wyniki badań wskazują też na zwiększone ryzyko wystąpienia suchości jamy ustnej, podrażnień śluzówki jamy ustnej i chorób dziąseł.

Wykorzystywanie elektronicznego papierosa w roli elementu wspomagającego rzucanie palenia tradycyjnych wyrobów tytoniowych może zatem mieć sens, jednak nie należy korzystać z tego rozwiązania długoterminowo.