Badania pokazują, że 75% pacjentów poddanych chemioterapii oraz 60% poddanych radioterapii zmaga się z zapaleniem w obrębie jamy ustnej i gardła. Zmiany pojawiają się w ciągu tygodnia lub dwóch od zastosowania pierwszej tury leczenia. Są to najczęściej bolesne nadżerki, owrzodzenia, zaczerwieniona śluzówka oraz krwawiące podniebienie. Częstym powikłaniem są grzybice jamy ustnej wywołane przez grzyby Candida albicans. Powszechnym problemem są też zmiany w obrębie uzębienia, obejmujące martwicę zębów oraz demineralizację szkliwa. W przypadku leczenia onkologicznego bardzo często dochodzi do upośledzenia funkcjonowania gruczołów ślinowych. Ślina staje się gęsta i lepka, jest jej mniej, a to sprzyja namnażaniu się bakterii powodujących próchnicę. Pacjenci skarżą się też na utrudnione żucie i połykanie pokarmu.

Aby zmniejszyć ryzyko wystąpienia ciężkich powikłań, konieczna jest odpowiednia higiena jamy ustnej; wskazane są też częste wizyty kontrolne w gabinecie stomatologicznym.